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linux上用PBS脚本运行matlab

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发表于 2020-2-26 17:16 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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我的目的:  希望在linux上用PBS脚本提交并运行matlab程序,需要运行的matlab程序文件名为CStest.m
! m& w' Q! n5 a已进行的操作
& j! J8 s- a; c& J& Z* l   1. 用了 Xshell 连接 linux 服务器;, }4 r* S/ d4 \. ]: f  X3 p: J
   2. 在Xshell中直接运行了我的m文件CStest.m是可以出结果的,输入的命令行指令为:
) M! `# L: A' ]3 R. ~& q$ t% g    /public/software/apps/MATLAB/R2019/bin/matlab-nodisplay -r CStest) E2 k' k. V' s; g) ~; T
    反馈结果如附图; P. f8 o2 w4 O" l% {( u# F+ O
   3. 在命令行用 vim CT2.pbs 指令编辑了pbs脚本并保存;
2 c' e* @% y" h8 j- e   4. 提交:qsub CT2.pbs;(提交后会报错)* E" z% c8 z. j0 X7 N
2 n( C8 A/ \3 H( ~( T
报错3 B+ u. P& [+ z: g/ [7 q# X3 @
出来一大堆信息,不是很看得懂,明显感觉有问题的报错是:- s) k) r, X  y: d0 L* ]
Can't exec "/cliparastor/tools/nWatch": No such file or directory at /cliparastor/sysctl/parastor_ctl_pm/pub_oper.pm line 367.
! k" _, A% ]/ f7 F
/ g$ L. ?: Z8 _. M  M# y* y: cPBS脚本内容
& y1 o. |" z( ^    #!/bin/bash# i; @# ?# D$ l
    #PBS -N a1$ A( L9 Y: b3 O4 J
    #PBS -I nodes=1:ppn=4
" y4 a* G5 W. Z2 X+ D! M: D    #PBS -j oe
# ?' L2 r' s4 Z/ w    #PBS -q low5 q; H6 C( x  ~1 f6 `9 G
    #PBS -I walltime=10:00:00
. K4 l0 v! V% o! G    cd $PBS_O_WORKDIR
, N' G" b7 i7 a8 z8 F+ m! _    /public/software/apps/MATLAB/R2019/bin/matlab <CStest.m6 Y7 d* V% q/ f$ s% N6 L
  _5 U, e0 W4 H* L
疑问:/ _/ g8 P. S3 o
   1. PBS脚本是否写的正确?
# u/ l2 g7 M4 L1 f% u2 E& m& B   2. 报的错误应该如何解决?
+ U7 Q6 t/ s; [2 p& A! @   
! @0 J! X# ^: r6 A! A' k7 Q请问有没有弄过的大神,可以帮忙看看~感谢感谢!!4 z* h$ T7 H$ L8 q1 k9 t3 z6 c6 R1 ]

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发表于 2020-2-26 17:56 | 只看该作者
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