opencl写的程序运行在FPGA上反而比CPU上差，为什么？？？

littlestupid

最近在学习opencl，写了一段smith-waterman算法计算得分矩阵的程序，运行在FPGA上反而比CPU上性能差。因为是初学，不知道写的哪里有问题。
附上代码：

__kernel void __attribute__ ((reqd_work_group_size(512,512,1)))krnl_sw(     __global int* ref,     __global int* alt,     __global int* sw,     __global int* btrack,     const int overhangStrategy,     const int match,     const int mismatch,     const int open,     const int extend,     const int ncol,     const int nrow     ) { int col = get_global_id(0); int row = get_global_id(1); for (k = 2;k<ncol+nrow-1;k++){    if(col + row == k)    {             up_score = sw[(row - 1)*ncol + col] + extend*(row-1) + open ;            left_score = sw[row*ncol + col - 1] + extend*(row-1) + open ;            up_left_score = sw[(row - 1)*ncol + col - 1] + diag_score(ref[col - 1], alt[row - 1], match, mismatch);            sw[row*ncol + col] = max(up_score, left_score);            sw[row*ncol + col] = max(up_left_score, sw[row*ncol + col]);    }}  return;}

大致的计算过程是初始化矩阵第一行和第一列，然后延对角线放向逐次计算斜对角上矩阵的得分。
( o$ H5 p. N9 j7 H" e" f" {

计算512*512的矩阵，运行10次，CPU上耗时100ms不到，FPGA上反而是几十秒，慢了近1000倍....

4 R- n$ D" m- m# E# T  g% u

Demyar

有代码就是好啊