TA的每日心情 | 怒 2019-11-20 15:22 |
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& Z& S+ W5 Q% P9 I7 Nmatlab降维工具包----drtoolbox3 ]7 W! W7 P: n% H
–很好安装,也很好用
9 v( M6 v- ~- |4 G" X7 \
9 R3 J1 N( w- P" V/ p安装
7 Y- Q, D3 C6 c: F- V
/ Q! Y( X6 M+ x; F2 W) e3 I9 G9 w# _- 下载后解压在一个文件夹里。
- 打开matlab,添加文件。
# C" M% S" a& u" B2 V
7 U/ h$ ^3 Z+ y1 W* f' l9 L- H
1 t$ M [$ {; P: V y2 f# d
3 a1 r# J5 k; ~- w7 h- J1 N
: e' _+ I5 x O: Z( g9 p运行“rehash toolboxcach”.显示“compilation completed”即完成加载。7 `# B# z6 j& x5 f
测试:. o$ t6 O. \" L6 j3 S
X = data;%数据每个样本为一行。7 |2 B7 R6 X! @4 V j, V
labels = label;
7 K' L/ |( A# o% Uno_dims = round(intrinsic_dim(X, 'MLE'));
. q; ]2 K) ^ a+ r, S. Ydisp(['MLE estimate of intrinsic dimensionality: ' num2str(no_dims)]);$ G8 S) t* s, V
+ x$ @4 w; o3 P5 H- g0 \6 i
% PCA降维% V9 i" X) l) o" x/ b
[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'PCAA', no_dims);
$ ?& p; u9 \& o" N7 C; w" y4 mfigure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);8 P" e/ r3 l; o5 }7 X% V
title('Result of PCA');
4 \6 l4 @/ ]2 l+ O2 D, ?. b%KPCA降维
$ A- r; S8 k/ \9 H. X% \[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'KPCA', no_dims);7 q4 j+ T9 h8 D7 ]
figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);! V8 e) _# _, a
title('Result of KPCA');
' _9 I: K+ d5 A) I. q/ y%LDA降维" x' j( [ l" U! B4 T/ x
[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'LDA', no_dims);
, Z" @ n" Q7 A. j7 x% W8 kfigure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);: P" p! R x# K! K" L6 T1 ^
title('Result of LDA');
5 \$ q5 X# I+ m3 Z. f% V, U2 j; T1 P# ?4 a# K. T: C
; g: W8 ?/ f+ x3 K8 f4 t9 ]
结果:$ m- F! o2 S5 J2 ?9 ^% T {' Z& U
4 \/ Q! c8 D5 u( T0 `% @" J
* A; M a6 e1 K3 h" U* |! W/ f2 f
) G' w. A: ^$ T8 `
+ F9 x6 Y. P8 v. n# P2 ^" G7 ]( V" k0 f! f4 ^
补充:: \3 g* P" o8 h' V* }0 A3 i" {
数据不知道怎么搞上去。就放个地址吧。链接:https: //pan.baidu.com/s/11CzO2_DWHds_PSTDtR69Sw8 V3 h B# @. y( l4 J5 r' ~) q+ l
提取码:9tfd
; K2 e" X: C; q) ]) k问题:在使用时,发现该工具箱中的pca函数与matlab自带函数冲突,便将该工具箱中的pca函数名字给改掉。如下:5 n+ ]1 Y/ H/ `- `. Q
0 L3 l+ ?4 P$ [3 m
: {4 z" f' G# d8 Q
+ y! {, P/ A2 [& ]0 L D; N8 I4 N
( u5 Y% O; `- |, j! n$ f
* ]% x. ^/ {6 U8 Y. a! b) j( W, e# v
1 i; ]! s/ Y N0 L6 X& a6 I
0 r$ r$ [0 t0 L! M# c这样以后用matlab本身的pca即
! {2 V- Y, e8 o6 b( g9 Y
6 u, ^/ z2 s- ^# e[coef,score,latent] =pca(data);
6 f \- N2 L' V3 N
8 q$ g% v7 N8 j" ~7 a& }3 W. _$ E! z$ z! E! D O( [: e: ?
调用该工具包中的pca利用
' K1 Y; Y. u& x. H/ L& r; {. E0 f9 h* C& n
[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'PCAA', no_dims);
$ m: D. E$ l! J s" U: cfigure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);, U/ I! D3 ~$ U' S
title('Result of PCA');`
4 j, F& i* U! I/ ?( K( h7 f @' x# I' h3 f2 L* \* e
* [9 t8 ? i6 s( G5 J; i
. P% `8 K0 ~4 H8 @- t' |
2 I: Y B" K r* t4 P, Q
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