了解一下matlab降维工具包-drtoolbox

mutougeda

" H0 g. H# V. o# Q% dmatlab降维工具包----drtoolbox
5 M7 ?/ P) N* }: {–很好安装，也很好用
( ]4 _/ Z# V) n  f3 z
5 m! `$ @! @* ^+ r3 w, q$ e安装
  E0 v! {4 D3 b$ n) W! f5 J
! j- B% Y9 U' {! p$ A8 P6 i

• 下载后解压在一个文件夹里。
• 打开matlab，添加文件。
  ; e- _( E. n" u+ t! j8 x8 l

" @/ r' W4 |/ b2 ^# y) E
3 o+ H& j' _7 M0 n$ j0 N# |5 Q3 p! L
3 s5 X4 B) g/ b' f# b5 o
7 N( e0 ~% p6 Z0 N运行“rehash toolboxcach”.显示“compilation completed”即完成加载。
+ }' C6 M- }& T1 O1 M# c测试：
2 s* |! ?) I' q+ m& i9 zX = data;%数据每个样本为一行。
" Y* ?& T# g, q. {% y- U+ elabels = label;
) }" j6 m; P  [0 t0 Pno_dims = round(intrinsic_dim(X, 'MLE'));
disp(['MLE estimate of intrinsic dimensionality: ' num2str(no_dims)]);

% PCA降维
[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'PCAA', no_dims);
figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);
4 `7 k8 b- X; _title('Result of PCA');
) ~% P* K  O( U%KPCA降维
2 p8 N" m/ G" d4 _[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'KPCA', no_dims);
figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);
* U* p$ X/ T8 F+ Y# s/ Ititle('Result of KPCA');
+ L/ X$ r8 q) R+ B%LDA降维
[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'LDA', no_dims);
figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);
title('Result of LDA');

1 o4 M, s# I: ~2 [" F+ [/ T: ~3 }
" x7 n  `/ H5 [2 S" B9 Z结果：
- \8 j% V+ H6 |3 e) n; i5 B0 j  n
6 d& b3 b9 o; R  j9 |7 C
. B+ l  x& I! z6 C9 S

1 s, C9 F, P+ Y% }4 R- |
补充：
6 y8 y+ J1 P6 a: i' e9 i' F数据不知道怎么搞上去。就放个地址吧。链接：https: //pan.baidu.com/s/11CzO2_DWHds_PSTDtR69Sw
提取码：9tfd
问题：在使用时，发现该工具箱中的pca函数与matlab自带函数冲突，便将该工具箱中的pca函数名字给改掉。如下：


8 q$ q0 U/ f( ~& Z8 u4 b9 O

. h% _* l. m* K# A4 Y; O6 X9 T

( |! E3 ^& \# W' a) t. w
这样以后用matlab本身的pca即

[coef,score,latent] =pca(data);


! k. {+ O- c2 b3 w调用该工具包中的pca利用

+ B; v: v7 I8 j) {& D& D$ ~5 L  \[mappedX, mapping] = compute_mapping(X, 'PCAA', no_dims);
figure, scatter(mappedX(:,1), mappedX(:,2), 5, labels);
' p% ]. b; l/ f0 T) Rtitle('Result of PCA');`

3 j8 R- K# w) m

5 w' U" x3 R& R! `) O) s% Z6 e
$ |4 b& m& ?) _( E# I" m2 a5 E

xiaogegepcb

matlab降维工具包-drtoolbox，学习啦